Produkty firmy Microsoft se staly de facto standardem pro klientská zařízení jednotlivců i společností všech velikostí. Nejběžnějším operačním systémem na stanicích v naší správě jsou Windows XP. Na nově kupovaných počítačích a notebocích jsou již Microsoft Windows 7.

Všechny stanice mají nainstalovaný kancelářský balík Microsoft Office ve verzi 2003, 2007, nebo 2010.

Obecně se držíme hesla "na uživatelské stanice Windows, na servery Linux", ale přesto je na serverech pro některé služby operační systém od firmy Microsoft nezbytností. V takovém případě spravujeme servery s Microsoft Windows Server 2003 a 2008.

Operační systém Microsoft Windows Server je instalovaný na servery zejména pro potřeby databázového serveru Microsoft SQL Server, který je mnoha aplikacemi vyžadován. Další využití serverového operačního systému je pro Microsoft Active Directory, které umožňuje efektivní správu uživatelských účtů, jejich oprávnění a zařazení do skupin, stejně tak jako centrální správu uživatelských stanic s využitím Microsoft Group Policy.

Umožňují-li to používané aplikace, pak Microsoft Active Directory přebírá správu přístupů pro tyto aplikace a uživatel je pak přihlašován automaticky na základě svého přihlášení na lokální stanici, přičemž po něm není vyžadováno další heslo (tzv. SSO - Single Sign On).